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Dans le cadre du projet ANR OVOPAUSE (ANR-22-CE45-0017), l’objectif est de développer un modèle de
détection et classification automatique de follicules ovariens, à partir de coupes histologiques 2D chez la
souris et d'imagerie 3D par transparisation chez le poisson. Les follicules ovariens sont des structures
multi-cellulaires qui contiennent les cellules germinales femelles. La maturation des follicules passe par
des étapes de croissance successives jusqu'à, pour certains d'entre eux, l'ovulation ou la ponte et la
libération de l'ovocyte mature. La répartition des follicules dans les différents stades de maturité, au
cours de la vie, détermine l'état reproducteur des individus et certains troubles de la fertilité sont
associés à une répartition perturbée. Le comptage des follicules ovariens, et leur classification, est donc
un enjeu majeur autant pour la recherche en biologie de la reproduction qu'en application clinique.
L e comptage manuel des follicules ovariens reste une tâche extrêmement fastidieuse et a conduit au
développement récent d’approches d’intelligence artificielle. Cependant, aucune méthode n'est
pleinement satisfaisante à ce jour et une amélioration globale de la classification et du comptage
automatique des follicules est attendue dans ce domaine.
Ce post-doctorat s'effectuera dans un environnement fortement interdisciplinaire, au plus près des
experts en biologie de la reproduction et en modélisation. Un corpus de données suffisant est déjà acquis
chez deux espèces modèles, la souris et le médaka.
Le contrat peut commencer dès maintenant et, au plus tard, avant le 1er novembre 2024. Voir document attaché pour plus de détails. Candidature sur lien ci-dessous:

https://recrutement.inria.fr/public/classic/en/offres/2024-07108